En el contexto de instalaciones fotovoltaicas (FV) aisladas, seleccionar la combinación óptima de módulos y baterías es crucial para garantizar un suministro de energía eficiente y fiable. Este documento presenta un Sistema de Soporte a la Decisión (SSD) diseñado para ayudar en el proceso de selección del desarrollo de nuevas instalaciones FV aisladas. Se emplean y comparan dos enfoques diferentes de toma de decisiones multicriterio (MCDM): AHP (Proceso de Jerarquía Analítica) combinado con TOPSIS (técnica para el orden de preferencia por similitud a la solución ideal) y Entropía combinada con TOPSIS. AHP y Entropía se utilizan para ponderar los criterios técnicos y económicos considerados, y TOPSIS clasifica las alternativas. Se realizó un análisis comparativo de los métodos AHP + TOPSIS y Entropía + TOPSIS para determinar su efectividad y aplicabilidad en escenarios del mundo real. Los resultados muestran que AHP y Entropía producen pesos de criterios contrastantes, sin embargo, TOPSIS converge en alternativas de alto rango similares utilizando cualquiera de los conjuntos de pesos, siendo la combinación de baterías de iones de litio con el módulo FV de selenuro de cobre, indio y galio como óptima. AHP permite la incorporación de la subjetividad de expertos, priorizando costos y un rendimiento energético intuitivo para proyectos FV. La objetividad de la Entropía eleva criterios con variabilidad de datos limitada, lo que puede representar erróneamente su verdadera importancia. A pesar de estas discrepancias, este estudio destaca las implicaciones prácticas de utilizar metodologías estructuradas de soporte a la decisión en la optimización de sistemas de energía renovable. Aunque la metodología propuesta se aplica a un sistema FV aislado, puede apoyar eficazmente la toma de decisiones para optimizar otras instalaciones autónomas o conectadas a la red, contribuyendo al avance de soluciones energéticas sostenibles.