Las respuestas de los árboles al manejo de fertilizantes son complejas y están influenciadas por las interacciones entre el medio ambiente, otros organismos y la genética combinada de los árboles compuestos. El aumento de la conciencia del consumidor sobre el impacto ambiental de la agricultura ha estimulado la investigación para aumentar la eficiencia en el uso de nutrientes, mejorar la sostenibilidad ambiental y maximizar la calidad. Aquí destacamos los avances recientes e identificamos las lagunas de conocimiento en la dinámica de nutrientes a lo largo del continuo suelo-rizosfera-árbol para los cultivos frutales. Las prácticas beneficiosas de manejo del suelo pueden mejorar la absorción de nutrientes y ha habido un progreso significativo en la comprensión de cómo las raíces, los microorganismos y el suelo interactúan para mejorar la adquisición de nutrientes en la rizosfera. Caracterizar la arquitectura de las raíces, in situ, sigue siendo uno de los mayores desafíos de investigación en la investigación de frutas perennes. Sin embargo, la última década ha avanzado en la caracterización de la absorción y transporte de nutrientes en las plantas, pero los estudios en cultivos de árboles frutales han sido limitados. El calcio, y su equilibrio relativo con otros macronutrientes, ha sido un enfoque principal para la investigación de nutrientes minerales debido a sus importantes contribuciones al desarrollo de trastornos fisiológicos. Sin embargo, la redistribución elemental anual hace que estas interacciones sean complejas. El desarrollo de nuevos enfoques para medir el movimiento de nutrientes en sistemas de suelo y plantas será fundamental para lograr una producción sostenible de frutas de alta calidad en el futuro.