Los folículos pilosos (FP) representan un tejido útil para monitorear el reloj circadiano en mamíferos. La exposición irregular a la luz causa disrupción circadiana y representa una preocupación por el bienestar de los caballos estabulados. Nuestro objetivo fue evaluar el impacto de dos regímenes de iluminación en establos sobre la ritmicidad de los genes del reloj circadiano en FP de caballos de carrera. Dos grupos de cinco caballos de carrera Thoroughbred en entrenamiento en un establo comercial fueron expuestos a luz incandescente estándar o a un sistema de iluminación LED personalizado. El grupo de control recibió luz de bombillas incandescentes utilizadas de acuerdo con la práctica estándar del establo. El grupo de tratamiento recibió luz LED blanca enriquecida en azul durante el día y luz LED roja tenue por la noche. En las semanas 0 y 20, se recolectaron pelos de la crin en intervalos de 4 horas durante 24 horas. Las muestras se almacenaron en RNAlater a -20 grados C. Se aisló ARN y las muestras fueron analizadas mediante PCR cuantitativa para los genes del reloj central: , , , , , y el gen controlado por el reloj . Los análisis de cosinor revelaron ritmicidad de 24 horas para y y se acercaron a la significancia para ( = 0.013, = 0.013 y = 0.051, respectivamente) en la semana 20 solo en el grupo de tratamiento. No se detectó ritmicidad en la semana 0 ni en la semana 20 en los FP de los caballos de control. Los resultados sugieren que las prácticas de iluminación en los establos de caballos de carrera podrían mejorarse para estimular mejor el funcionamiento óptimo del sistema circadiano.