La eficiencia de la computación del ADN está estrechamente relacionada con el diseño de las secuencias de codificación del ADN. Con el fin de obtener secuencias de codificación del ADN superiores, es necesario elegir restricciones de ADN adecuadas para prevenir posibles interacciones conflictivas en diferentes secuencias de ADN y garantizar la fiabilidad de las secuencias de ADN. En este artículo se propone un algoritmo de optimización de enjambre de partículas de matriz mejorado, denominado IMPSO, para optimizar el diseño de secuencias de ADN. Además, este artículo incorpora el aprendizaje basado en la oposición del centroide para preservar completamente la diversidad de la población y desarrolla y adapta una actualización dinámica sobre la base de la distancia de relación señal-ruido para buscar soluciones de alta calidad de manera suficientemente inteligente. Los resultados muestran que la propuesta de este artículo logra resultados satisfactorios y puede obtener una mayor eficiencia computacional.