Las células madre pluripotentes (CMSP) son importantes para futuras terapias de medicina regenerativa. Sin embargo, en la producción de CMSP y sus derivados, el control de las fluctuaciones inducidas por la cultura en el resultado de la calidad celular sigue siendo un desafío. Un entendimiento detallado de cómo se alteran los comportamientos de las CMSP en respuesta a los microambientes biomecánicos dentro de una cultura es necesario para la optimización racional del bioprocesamiento. En esta revisión, discutimos ideas recientes sobre el papel del equilibrio mecánico y del comportamiento celular en la modulación de los estados y funciones de las CMSP durante los procesos de cultivo. Delimitamos formas prometedoras de manipular la variabilidad de la cultura mediante la regulación de los comportamientos celulares utilizando herramientas actualmente desarrolladas. Además, anticipamos su implementación potencial para diseñar una estrategia de cultivo basada en el concepto del paisaje epigenético de Waddington que pueda proporcionar una solución factible para ajustar la calidad y estabilidad de la cultura en el espacio de bioprocesamiento.