En este artículo, exploramos cómo el software de código abierto sirve como un habilitador estratégico para la seguridad y la protección en la transformación digital de los sistemas logísticos. Se examina el código abierto en múltiples dimensiones, incluyendo la transparencia, la colaboración comunitaria, la soberanía digital y la resiliencia de la infraestructura a largo plazo. El análisis se centra en el dominio logístico, donde la interoperabilidad, la protección de la infraestructura crítica y la continuidad de la cadena de suministro son esenciales. Elementos clave del desarrollo de código abierto, como arquitecturas modulares, marcos legales y de licencias, y bases de código revisadas por pares, apoyan la gestión rápida de vulnerabilidades, aumentan la transparencia y crean ecosistemas digitales sostenibles. Se hace hincapié en el papel de los modelos de código abierto en el fortalecimiento de la confianza institucional, la reducción de la dependencia de proveedores propietarios y la mejora de la capacidad de respuesta ante amenazas cibernéticas. Nuestros hallazgos indican que el código abierto no es simplemente una alternativa técnica, sino una decisión estratégica con implicaciones legales, económicas y políticas, que da forma a entornos digitales seguros, soberanos y adaptativos, particularmente en sectores críticos para la misión.