La variante Omicron XBB.1 y sus descendientes: mutaciones genómicas, rápida diseminación y características notables
Autores: Giancotti, Raffaele; Lomoio, Ugo; Puccio, Barbara; Tradigo, Giuseppe; Vizza, Patrizia; Torti, Carlo; Veltri, Pierangelo; Guzzi, Pietro Hiram
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La variante Omicron XBB.1 y sus descendientes: mutaciones genómicas, rápida diseminación y características notables
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Virus
Mutaciones
Variantes
Proteína de espiga
ACE2
Vacunas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
El virus SARS-CoV-2, que representa una gran amenaza para la salud humana, ha sufrido muchas mutaciones durante el proceso de replicación debido a errores en los pasos de replicación y modificaciones en la estructura de las proteínas virales. La variante XBB fue identificada por primera vez en Singapur en el otoño de 2022. Luego se detectó en otros países, incluidos Estados Unidos, Canadá y el Reino Unido. Estudiamos el impacto de los cambios de secuencia en la estructura de la proteína de espiga en los subvariantes de XBB, prestando especial atención a la velocidad de difusión de la variante y la actividad del virus con respecto a su difusión. Examinamos las distinciones estructurales y funcionales de las variantes en tres conformaciones diferentes: (i) glicoproteína de espiga en complejo con ACE2 (estado 1-up), (ii) glicoproteína de espiga (estado cerrado-1) y (iii) proteína S (estado abierto-1). También estimamos la afinidad de unión entre la proteína de espiga y ACE2. La afinidad de unión observada en variantes específicas plantea preguntas sobre la eficacia de las vacunas actuales para preparar al sistema inmunológico para el reconocimiento de variantes del virus. Este trabajo puede ser útil para diseñar estrategias para gestionar la pandemia de COVID-19 en curso. Para mantenerse a la vanguardia de la evolución del virus, se deben llevar a cabo más investigaciones y vigilancia para ajustar las medidas de salud pública en consecuencia.
Descripción
El virus SARS-CoV-2, que representa una gran amenaza para la salud humana, ha sufrido muchas mutaciones durante el proceso de replicación debido a errores en los pasos de replicación y modificaciones en la estructura de las proteínas virales. La variante XBB fue identificada por primera vez en Singapur en el otoño de 2022. Luego se detectó en otros países, incluidos Estados Unidos, Canadá y el Reino Unido. Estudiamos el impacto de los cambios de secuencia en la estructura de la proteína de espiga en los subvariantes de XBB, prestando especial atención a la velocidad de difusión de la variante y la actividad del virus con respecto a su difusión. Examinamos las distinciones estructurales y funcionales de las variantes en tres conformaciones diferentes: (i) glicoproteína de espiga en complejo con ACE2 (estado 1-up), (ii) glicoproteína de espiga (estado cerrado-1) y (iii) proteína S (estado abierto-1). También estimamos la afinidad de unión entre la proteína de espiga y ACE2. La afinidad de unión observada en variantes específicas plantea preguntas sobre la eficacia de las vacunas actuales para preparar al sistema inmunológico para el reconocimiento de variantes del virus. Este trabajo puede ser útil para diseñar estrategias para gestionar la pandemia de COVID-19 en curso. Para mantenerse a la vanguardia de la evolución del virus, se deben llevar a cabo más investigaciones y vigilancia para ajustar las medidas de salud pública en consecuencia.