Las legumbres son cultivos alimentarios importantes y desempeñan un papel central en la agricultura sostenible gracias a su capacidad para formar simbiosis con rizobios, bacterias del suelo que fijan el nitrógeno atmosférico. Los avances recientes en transcriptómica de una sola célula y espacial, junto con la epigenómica de una sola célula, han permitido un análisis de alta resolución de la dinámica de expresión génica y la predicción de redes regulatorias específicas de tipos celulares. En esta revisión, destacamos los avances recientes en el uso de ómicas de una sola célula en legumbres, con un enfoque particular en cómo los genes que funcionan en distintos tipos celulares contribuyen al desarrollo de las plantas, las respuestas a patógenos, la plasticidad inducida por estrés y el establecimiento de simbiosis en los nódulos radiculares. Estudios de caso en , , , y ilustran el cambio de ómicas masivas a ómicas multi-celulares de una sola célula. Concluimos esbozando las limitaciones actuales y las direcciones futuras para construir atlas celulares integrados de legumbres que apoyen la investigación traslacional y la mejora de cultivos.