El efecto del tratamiento con oligochitosán O-80 en los cambios metabólicos en brotes de rábano blanco (L.) (WRS) se investigó por su potencial para mejorar la acumulación de compuestos bioactivos. Las semillas se germinaron en agua desionizada conteniendo diferentes concentraciones de oligochitosán O-80 (0 (control), 5, 10, 20 y 40 ppm). Los brotes de siete días se cosecharon para el análisis del metaboloma utilizando cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS) y cromatografía líquida de alta resolución (HPLC) para el análisis de compuestos fenólicos y glucosinolatos, respectivamente, y ensayos espectrofotométricos para determinar el contenido fenólico total y la capacidad antioxidante. Se adoptó el análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales para modelar los datos de la LC-MS y reveló que O-80 en todas las concentraciones probadas afectó los perfiles de metabolitos de las muestras de WRS tratadas. El cromatograma UV a 320 nm mostró niveles aumentados de la mayoría de los derivados de sinapilo, consistentes con los contenidos fenólicos totales aumentados. Interesantemente, el glucorafasatina (glucosinolato de 4-metiltio-3-butenilo), un glucosinolato importante detectado por HPLC, aumentó en un 40% en los brotes tratados con 10 ppm de O-80. Nuestros resultados proporcionan evidencia convincente sobre la aplicación exógena de oligochitosán O-80 como un elicitor de metabolitos bioactivos en WRS.