y spp. son patógenos microsporidios con potencial zoonótico que representan preocupaciones significativas para la salud pública. Para determinar la ocurrencia y los genotipos de y spp., utilizamos PCR anidada para amplificar el gen del espaciador transcrito interno (ITS) y secuenciación de ADN para analizar 198 muestras fecales de pandas rojos de 6 zoológicos en China. La tasa total de infección microsporidial fue del 15.7% (31/198), con un 12.1% (24/198), 1.0% (2/198), 2.0% (4/198) y 1.0% (2/198) para la tasa de infección de , , y , respectivamente. Se detectó un panda rojo positivo para una infección mixta (y ). Los pandas rojos que viven en condiciones semi-libres tienen más probabilidades de estar infectados con microsporidios ( = 6.212, df = 1, < 0.05). Se encontraron tres genotipos conocidos (SC02, D y PL2) y un nuevo (SCR1) de . Tres genotipos de (SC02, D, SCR1) se agruparon en el grupo 1 con importancia para la salud pública, mientras que el genotipo PL2 formó un clado separado asociado con el grupo 2. Estos hallazgos sugieren que los pandas rojos pueden servir como un reservorio huésped para microsporidios zoonóticos, permitiendo potencialmente la transmisión de pandas rojos a humanos y otros animales.