En este documento, obtenemos principios de incertidumbre asociados con la transformada canónica lineal (LCT) de funciones hipercomplejas. Primero, derivamos el principio de incertidumbre para funciones hipercomplejas en los dominios de tiempo y LCT. Además, explotamos el principio de incertidumbre en dos dominios LCT. Los límites inferiores están relacionados con los parámetros de LCT y la covarianza, y el principio de incertidumbre presentado aquí es más preciso que lo que se ha presentado en la literatura existente. Estos límites más ajustados se pueden obtener utilizando funciones de chirrido hipercomplejas para una envolvente gaussiana. Finalmente, verificamos la validez de los principios de incertidumbre a través de algunos ejemplos y discutimos varias aplicaciones potenciales de los nuevos resultados en el procesamiento de señales.