Los carcinomas hepatocelulares (HCC) son tumores comunes, mientras que los adenomas hepatocelulares (HCA) son tumores raros y benignos en perros. La expresión aberrante de ARN no codificantes (ncRNAs) juega un papel fundamental en la tumorogénesis y progresión del HCC. Entre los ncRNAs, los microARNs han sido ampliamente investigados en el HCC humano, pero mucho menos en el HCC canino. Sin embargo, los fragmentos derivados del ARN Y aún no se han investigado en el HCC y HCA caninos. Este estudio se centró en pacientes con HCC y HCA caninos. Utilizamos qRT-PCR para determinar la expresión del ARN Y en tejidos clínicos, plasma y vesículas extracelulares del plasma, y en dos líneas celulares de HCC (95-1044 y AZACH). El ARN Y se redujo significativamente en tejido, plasma y vesículas extracelulares del plasma para el HCC canino en comparación con el HCA canino y los controles sanos. El ARN Y se redujo en las células 95-1044 y AZACH en comparación con el tejido hepático normal y en AZACH en comparación con las células 95-1044. En las muestras de plasma, los niveles de ARN Y se redujeron en HCC en comparación con HCA y controles sanos, y aumentaron en HCA en comparación con controles sanos. El análisis de características operativas del receptor mostró que el ARN Y podría ser un biomarcador prometedor para distinguir HCC de HCA y controles sanos. En general, la expresión desregulada del ARN Y puede distinguir el HCC canino del HCA. Sin embargo, se necesita más investigación para elucidar los mecanismos moleculares relacionados con el ARN Y en enfermedades neoplásicas hepatocelulares. Hasta donde sabemos, este es el primer informe sobre la expresión relativa del ARN Y en el HCC y HCA caninos.