Identificación de un nuevo locus de riesgo de epilepsia idiopática y una variante en el gen en el perro perdiguero holandés
Autores: Beckers, Evy; Bhatti, Sofie F. M.; Van Poucke, Mario; Polis, Ingeborgh; Farnir, Frédéric; Van Nieuwerburgh, Filip; Mandigers, Paul; Van Ham, Luc; Peelman, Luc; Broeckx, Bart J. G.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de un nuevo locus de riesgo de epilepsia idiopática y una variante en el gen en el perro perdiguero holandés
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Causa genética
Loci de riesgo
Estudio de asociación del genoma completo
Secuencia codificante
Secuenciación de todo el exoma
Convulsiones epilépticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
(1) Se piensa que la epilepsia idiopática (EI) tiene una causa genética en varias razas de perros. Sin embargo, hasta la fecha solo se han identificado dos variantes causales y se conocen pocos loci de riesgo. No se han realizado estudios genéticos sobre la EI en el perro perdiguero holandés (DPD), y se ha informado poco sobre el fenotipo epiléptico en esta raza. (2) Se utilizaron cuestionarios llenados por los propietarios e investigaciones diagnósticas para caracterizar la EI en el DPD. Se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) que involucró 16 casos y 43 controles, seguido de la secuenciación de la secuencia codificante y las regiones de sitios de empalme de un gen candidato dentro de la región asociada. Posteriormente, se realizó una secuenciación de exoma completo (WES) de una familia (incluyendo un perro afectado por EI, ambos padres y un hermano libre de EI). (3) La EI en el DPD tiene un amplio rango en términos de edad de inicio, frecuencia y duración de las convulsiones epilépticas. La mayoría de los perros mostraron convulsiones epilépticas focales que evolucionaron a convulsiones generalizadas. Se identificó un nuevo locus de riesgo en el cromosoma 12 (BICF2G630119560; p = 4.4 x 10; p = 0.043) a través del GWAS. La secuenciación del gen candidato no reveló variantes de interés. No se localizaron variantes de WES dentro de la región asociada al GWAS. Sin embargo, se descubrió una variante en (cromosoma 10; XM_038680630.1: c.689C > T), y los perros homocigotos para la variante (T/T) tenían un mayor riesgo de desarrollar EI (OR: 6.0; IC 95%: 1.6-22.6). Esta variante fue identificada como probablemente patogénica según las directrices de ACMG. (4) Se necesita más investigación antes de que el locus de riesgo o la variante puedan ser utilizados para decisiones de cría.
Descripción
(1) Se piensa que la epilepsia idiopática (EI) tiene una causa genética en varias razas de perros. Sin embargo, hasta la fecha solo se han identificado dos variantes causales y se conocen pocos loci de riesgo. No se han realizado estudios genéticos sobre la EI en el perro perdiguero holandés (DPD), y se ha informado poco sobre el fenotipo epiléptico en esta raza. (2) Se utilizaron cuestionarios llenados por los propietarios e investigaciones diagnósticas para caracterizar la EI en el DPD. Se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) que involucró 16 casos y 43 controles, seguido de la secuenciación de la secuencia codificante y las regiones de sitios de empalme de un gen candidato dentro de la región asociada. Posteriormente, se realizó una secuenciación de exoma completo (WES) de una familia (incluyendo un perro afectado por EI, ambos padres y un hermano libre de EI). (3) La EI en el DPD tiene un amplio rango en términos de edad de inicio, frecuencia y duración de las convulsiones epilépticas. La mayoría de los perros mostraron convulsiones epilépticas focales que evolucionaron a convulsiones generalizadas. Se identificó un nuevo locus de riesgo en el cromosoma 12 (BICF2G630119560; p = 4.4 x 10; p = 0.043) a través del GWAS. La secuenciación del gen candidato no reveló variantes de interés. No se localizaron variantes de WES dentro de la región asociada al GWAS. Sin embargo, se descubrió una variante en (cromosoma 10; XM_038680630.1: c.689C > T), y los perros homocigotos para la variante (T/T) tenían un mayor riesgo de desarrollar EI (OR: 6.0; IC 95%: 1.6-22.6). Esta variante fue identificada como probablemente patogénica según las directrices de ACMG. (4) Se necesita más investigación antes de que el locus de riesgo o la variante puedan ser utilizados para decisiones de cría.