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Identificación de un nuevo locus de riesgo de epilepsia idiopática y una variante en el gen en el perro perdiguero holandés

Autores: Beckers, Evy; Bhatti, Sofie F. M.; Van Poucke, Mario; Polis, Ingeborgh; Farnir, Frédéric; Van Nieuwerburgh, Filip; Mandigers, Paul; Van Ham, Luc; Peelman, Luc; Broeckx, Bart J. G.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación de un nuevo locus de riesgo de epilepsia idiopática y una variante en el gen en el perro perdiguero holandés


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Causa genética
Loci de riesgo
Estudio de asociación del genoma completo
Secuencia codificante
Secuenciación de todo el exoma
Convulsiones epilépticas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
(1) Se piensa que la epilepsia idiopática (EI) tiene una causa genética en varias razas de perros. Sin embargo, hasta la fecha solo se han identificado dos variantes causales y se conocen pocos loci de riesgo. No se han realizado estudios genéticos sobre la EI en el perro perdiguero holandés (DPD), y se ha informado poco sobre el fenotipo epiléptico en esta raza. (2) Se utilizaron cuestionarios llenados por los propietarios e investigaciones diagnósticas para caracterizar la EI en el DPD. Se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) que involucró 16 casos y 43 controles, seguido de la secuenciación de la secuencia codificante y las regiones de sitios de empalme de un gen candidato dentro de la región asociada. Posteriormente, se realizó una secuenciación de exoma completo (WES) de una familia (incluyendo un perro afectado por EI, ambos padres y un hermano libre de EI). (3) La EI en el DPD tiene un amplio rango en términos de edad de inicio, frecuencia y duración de las convulsiones epilépticas. La mayoría de los perros mostraron convulsiones epilépticas focales que evolucionaron a convulsiones generalizadas. Se identificó un nuevo locus de riesgo en el cromosoma 12 (BICF2G630119560; p = 4.4 x 10; p = 0.043) a través del GWAS. La secuenciación del gen candidato no reveló variantes de interés. No se localizaron variantes de WES dentro de la región asociada al GWAS. Sin embargo, se descubrió una variante en (cromosoma 10; XM_038680630.1: c.689C > T), y los perros homocigotos para la variante (T/T) tenían un mayor riesgo de desarrollar EI (OR: 6.0; IC 95%: 1.6-22.6). Esta variante fue identificada como probablemente patogénica según las directrices de ACMG. (4) Se necesita más investigación antes de que el locus de riesgo o la variante puedan ser utilizados para decisiones de cría.

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