Un nuevo alelo en el promotor de disminuye la expresión génica y confiere menores contenidos aparentes de amilopectina en arroz (L.)
Autores: Tang, Weijie; Chen, Haiyuan; Zhang, Suobing; Tang, Jun; Lin, Jing; Fang, Xianwen; Chen, Gaoming; Zhang, Yunhui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Un nuevo alelo en el promotor de disminuye la expresión génica y confiere menores contenidos aparentes de amilopectina en arroz (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Gen clave
Contenido de amilopectina
Alelos
Promotor
Edición
AAC
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
es el gen clave que controla el contenido de amilopectina (AC), y se han encontrado varias alelos en poblaciones de arroz. es el alelo mayor en y produce un AC moderado (15~18%). Se descubrió recientemente que editar el promotor de podría producir una serie de alelos que tienen diferentes actividades de Wx. Aunque algunos estudios han editado el promotor, pocos estudios se han centrado en las variaciones naturales en. Aquí, utilizamos la base de datos Rice3K para investigar variaciones en el promotor y encontramos que el alelo Wx1764178 (A/G) tiene un LD (desequilibrio de ligamiento) más alto con los dos SNP clave (1765751, T/G; 1768006, A/C), que podrían producir diferentes alelos e influir en el AC, como se informó anteriormente. Un estudio adicional mostró que el alelo Wx1764178 (A/G) es funcional e influye positivamente en la expresión de. La edición del alelo A utilizando CRISPRCas9 produjo deleciones de 36 y 3 pb y causó una disminución en la expresión de. El contenido aparente de amilopectina (AAC) en las líneas editadas se redujo en un 7.09% y un 11.50% en comparación con el tipo silvestre, que era la variedad Nipponbare con y el alelo A en 1764178, mientras que una línea complementaria con el alelo G mostró un AAC más bajo que el alelo A sin efecto en otros rasgos agronómicos. El AAC de las líneas editadas mostró un aumento mayor que el del tipo silvestre (Nipponbare,) en condiciones de bajo nitrógeno en relación con condiciones de alto nitrógeno. También desarrollamos un marcador dCAPS para identificar el alelo y encontramos que el alelo G ha sido ampliamente utilizado (82.95%) en variedades de arroz de la provincia de Jiangsu, China. En general, encontramos un alelo funcional (Wx1764178, A/G) en el promotor que podría afectar el AAC en cultivares y ser desarrollado como marcadores para la mejora de calidad en programas de cría de arroz.
Descripción
es el gen clave que controla el contenido de amilopectina (AC), y se han encontrado varias alelos en poblaciones de arroz. es el alelo mayor en y produce un AC moderado (15~18%). Se descubrió recientemente que editar el promotor de podría producir una serie de alelos que tienen diferentes actividades de Wx. Aunque algunos estudios han editado el promotor, pocos estudios se han centrado en las variaciones naturales en. Aquí, utilizamos la base de datos Rice3K para investigar variaciones en el promotor y encontramos que el alelo Wx1764178 (A/G) tiene un LD (desequilibrio de ligamiento) más alto con los dos SNP clave (1765751, T/G; 1768006, A/C), que podrían producir diferentes alelos e influir en el AC, como se informó anteriormente. Un estudio adicional mostró que el alelo Wx1764178 (A/G) es funcional e influye positivamente en la expresión de. La edición del alelo A utilizando CRISPRCas9 produjo deleciones de 36 y 3 pb y causó una disminución en la expresión de. El contenido aparente de amilopectina (AAC) en las líneas editadas se redujo en un 7.09% y un 11.50% en comparación con el tipo silvestre, que era la variedad Nipponbare con y el alelo A en 1764178, mientras que una línea complementaria con el alelo G mostró un AAC más bajo que el alelo A sin efecto en otros rasgos agronómicos. El AAC de las líneas editadas mostró un aumento mayor que el del tipo silvestre (Nipponbare,) en condiciones de bajo nitrógeno en relación con condiciones de alto nitrógeno. También desarrollamos un marcador dCAPS para identificar el alelo y encontramos que el alelo G ha sido ampliamente utilizado (82.95%) en variedades de arroz de la provincia de Jiangsu, China. En general, encontramos un alelo funcional (Wx1764178, A/G) en el promotor que podría afectar el AAC en cultivares y ser desarrollado como marcadores para la mejora de calidad en programas de cría de arroz.