La tecnología de pantalla genética se ha aplicado para estudiar el mecanismo de acción de las toxinas bacterianas, una clase especial de factores de virulencia que contribuyen a la patogénesis causada por infecciones bacterianas. Estas pantallas tienen como objetivo identificar factores hospedadores que facilitan directa o indirectamente la intoxicación por toxinas. Además, propiedades específicas de ciertas toxinas, como la interacción con la membrana, el tráfico retrógrado y la unión a carbohidratos, proporcionan sondas robustas para investigar de manera exhaustiva la biosíntesis de lípidos, el transporte de vesículas de membrana y las vías de glicosilación, respectivamente. Esta revisión se centra específicamente en pantallas genéticas recientes basadas en toxinas representativas que han identificado nuevos actores involucrados y han proporcionado nuevas perspectivas sobre vías biológicas fundamentales, como la biosíntesis de glicoesfingolípidos, la glicosilación de proteínas y las vías de tráfico de vesículas de membrana. Caracterizar funcionalmente estos factores recién identificados no solo amplía nuestra comprensión actual de la biología de las toxinas, sino que también permite una comprensión más profunda de preguntas biológicas fundamentales. En consecuencia, estimula el desarrollo de nuevos enfoques terapéuticos dirigidos tanto a enfermedades infecciosas bacterianas como a trastornos genéticos con defectos en estos factores y vías.