Este estudio investiga cómo las nuevas instituciones de I+D median las disyunciones entre políticas y mercados para fomentar ecosistemas integrados de innovación y emprendimiento. Empleando un análisis de caso longitudinal (2013-2023) del Instituto de Investigación de Tecnología Industrial de Jiangsu (JITRI), delineamos un proceso evolutivo en tres fases: (1) una fase inicial dominada por el gobierno, que estimula el desarrollo de capacidades fundamentales a través de I+D por contrato; (2) una fase de mercantilización subsiguiente, que permite la integración sistémica de recursos a través de centros de co-creación y redes globales; y (3) una fase de sinergia culminante, donde la alineación entre políticas y mercados facilita la optimización del ecosistema a través de I+D crowdsourced y colaboración entre dominios. Tres mecanismos clave sustentan esta adaptación: acoplamiento entre políticas y mercados (proporcionando impulso externo), desarrollo de capacidades endógenas (absorción hacia la innovación) y orquestación dinámica de recursos (adquisición hacia la optimización). El modelo de gobernanza híbrido de JITRI demuestra que las intervenciones contingentes a la etapa, específicamente, el anclaje de políticas en las primeras etapas seguido de la asignación de recursos receptiva al mercado, transforman efectivamente las tensiones inherentes en sinergias productivas. Estos hallazgos generan marcos implementables para estructurar ecosistemas innovadores y subrayan la necesidad de estudios comparativos para establecer una mayor generalizabilidad teórica.