La información sobre las respuestas fisiológicas y moleculares de las plantas al tratamiento con nuevos biofertilizantes es limitada. En este estudio, se evaluó un enmienda de suelo de compostaje rápido obtenida de residuos sólidos mediante una reacción de Fenton para evaluar los efectos en el crecimiento de plántulas de L. var. longifolia. La tasa de crecimiento, la biomasa de raíces, la concentración de clorofila y las proteínas solubles totales de las plántulas tratadas con el 2% de la enmienda de suelo de compostaje rápido mostraron aumentos significativos en comparación con las plántulas de control. El análisis proteómico reveló que la enmienda de suelo indujo la regulación positiva de proteínas pertenecientes a la maquinaria de fotosíntesis, el metabolismo de carbohidratos y promovió el metabolismo energético. La proteómica de raíces indicó que la enmienda de suelo de compostaje rápido indujo fuertemente la morfogénesis y el desarrollo de los órganos; el desarrollo de la cofia radicular, la formación de raíces laterales y la morfogénesis radicular post-embriónica fueron los principales procesos biológicos enriquecidos por el tratamiento. En general, nuestros datos sugieren que la adición de la formulación de enmienda de suelo de compostaje rápido a los suelos base podría mejorar el crecimiento de las plantas al inducir el metabolismo primario de carbohidratos y la diferenciación de un sistema radicular robusto.