La aplicación de labranza intensiva (CT) en los olivares mediterráneos ha amenazado la calidad del suelo y ha llevado a la degradación del mismo. La labranza cero con suelo desnudo (NT+H) se ha considerado como una práctica alternativa a este sistema de manejo; sin embargo, existen discrepancias en la literatura sobre los resultados de la aplicación de esta práctica. Nuestro objetivo principal fue evaluar el impacto de la labranza continua y la labranza cero en la estabilidad de los agregados del suelo, así como en las existencias de C orgánico del suelo y N orgánico del suelo. El estudio se llevó a cabo en un olivar mediterráneo de secano en condiciones semiáridas en un Cambisol Cálcico, durante 16 años evaluando perfiles completos de suelo (0-120 cm de profundidad). A largo plazo, las prácticas de manejo CT1 y NT+H afectaron significativamente el tamaño de las partículas de los agregados al reducir el porcentaje de macroagregados (>250 m) y promover un mayor número de microagregados (2000 m) porcentaje. Con respecto a estos resultados, los índices de estabilidad estructural del suelo mostraron una disminución significativa tanto en el Diámetro Medio Ponderado (MWD) como en los valores del Diámetro Medio Geométrico (GMD) con pérdidas de más del 50% con respecto al período inicial (CT0) en los dos primeros horizontes. A largo plazo, tanto en CT1 como en NT+H, se encontraron concentraciones de C orgánico más altas en horizontes profundos mostrando una redistribución de C en profundidad y pérdidas importantes en los valores de N total, mientras que en CT0, los macroagregados contenían los valores más altos de CPC, después de largo plazo ambas prácticas de manejo (CT1 y NT+H) afectaron la dinámica del C y se caracterizaron por un mayor almacén de C en los microagregados que en las fracciones de macroagregados. Por lo tanto, a largo plazo NT+H y CT1 mostraron un deterioro del almacenamiento de C orgánico del suelo y una mayor susceptibilidad a la descomposición, emisiones de CO y pérdidas de fertilidad. Esta tendencia, es decir, disminuciones en las existencias de C orgánico del suelo tras la labranza cero, confirma estudios previos sobre el tema y apunta a impactos en el equilibrio de nutrientes.