La deposición antropogénica de nitrógeno (N) y azufre (S) puede cambiar la biodiversidad tanto por encima como por debajo del suelo, incluida la diversidad microbiana del suelo. La diversidad de microorganismos desnitrificantes es de gran importancia para el cálculo del ciclo global del nitrógeno y el flujo de nitrógeno. Durante mucho tiempo, se han utilizado como los genes funcionales para estudiar microorganismos desnitrificantes y se han convertido gradualmente en marcadores moleculares para estudiar la composición y diversidad de las bacterias desnitrificantes. Aquí, se establecieron exposiciones independientes a aplicaciones de N y S en tres momentos (7, 30 y 60 días). Además, se examinaron la abundancia, diversidad y estructura de las comunidades desnitrificantes de tipo - y - mediante análisis de secuenciación en respuesta a tres tratamientos, a saber, N y S (T), cloruro de sodio (T) y agua desionizada (pH = 7.0) (CK). Nuestros resultados sugieren que T condujo a una mayor conductividad eléctrica (EC), nitrógeno total (TN), carbono orgánico total (TOC), nitrógeno nitrato (NO-N), nitrógeno amoniacal (NH-N) y un pH más bajo en comparación con T y CK, lo que afectó la diversidad de las comunidades bacterianas desnitrificantes de tipo - y -. También observamos que la comunidad desnitrificante de tipo - mostró una mayor sensibilidad a las adiciones de N y S. En general, nuestros resultados son importantes para la comprensión del nitrógeno en el suelo y las emisiones de NO.