Siguiendo la idea de una bioeconomía circular, el uso de subproductos como sustitutos de los medios de cultivo en los bioprocesos significaría una enorme ventaja económica y ecológica. Los compuestos costosos en medios convencionales para la producción del triterpeno escualeno en thraustochytridos son la principal fuente de carbono y fuentes de nitrógeno complejas. Entre otros subproductos examinados, los extractos del micelio gastado del basidiomiceto fueron los más adecuados para actuar como fuentes de nitrógeno alternativas en los medios de cultivo para thraustochytridos. Se determinaron los contenidos totales de nitrógeno (3,76 +/- 0,01 y 4,24 +/- 0,04%, respectivamente) y de proteína (16,47 +/- 0,06 y 18,57 +/- 0,18%, respectivamente) del cuerpo fructífero y el micelio. Las células fúngicas fueron hidrolizadas y extraídas para generar fuentes de nitrógeno accesibles. En condiciones preferidas, los extractos del cuerpo fructífero y del micelio contenían 73,63 +/- 1,19 y 89,93 +/- 7,54 mM de grupos amino libres, respectivamente. Los cultivos de la cepa S31 en un medio que utiliza un extracto de micelio como fuente de nitrógeno compleja mostraron un crecimiento más lento pero un rendimiento de escualeno similar (123,79 +/- 14,11 mg/L después de 216 h) en comparación con un medio convencional (111,29 +/- 19,96 mg/L, aunque mejorable con una fuente adicional de nitrógeno complejo).