, valorada por sus diversos colores de flores y formas atractivas, es una planta acuática ornamental popular. Los antocianos proporcionan color a las flores, y su biosíntesis está regulada por el factor de transcripción R2R3-MYB. En este estudio, identificamos y analizamos los genes R2R3-MYB en , centrándonos en su estructura, evolución, patrones de expresión, mecanismos regulatorios y funciones biológicas. También investigamos el papel del gen en la biosíntesis de antocianos. Había 59 genes R2R3-MYB en , distribuidos en 14 cromosomas. Entre estos, 14 genes estaban involucrados en duplicaciones segmentarias y 6 en duplicaciones en tándem. Múltiples factores de transcripción R2R3-MYB parecían desempeñar un papel en procesos biológicos en , incluyendo NcMYB48 en la síntesis de flavonoides, NcMYB33 en la síntesis de lignina, NcMYB23 en la respuesta al estrés por frío y NcMYB54 en la respuesta al estrés osmótico. Además, identificamos 92 miARN en , con 43 interactuando con 35 genes R2R3-MYB. La proteína NcMYB25 está localizada en el núcleo y posee actividad de activación transcripcional. La sobreexpresión del gen en un pericarpio de manzana resultó en acumulación de antocianos. Estos hallazgos proporcionan información sobre la trayectoria evolutiva de los genes R2R3-MYB en y destacan la función reguladora del gen en la biosíntesis de antocianos.