Las manchas foliares de Glomerella (GLS) y la podredumbre amarga (BR) son enfermedades severas de la manzana y son las principales especies en Brasil. Para controlar GLS y BR en los huertos de manzana brasileños, se siguen utilizando fungicidas como el mancozeb y el tiophanate-metilo a pesar de la resistencia reportada a estos ingredientes activos. Además, el mancozeb ha sido prohibido en los países importadores de manzanas y ha sido un gran desafío para los productores de manzana encontrar productos que lo reemplacen y que sean ecológicos. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo buscar alternativas para controlar las enfermedades. Evaluamos la actividad antifúngica del eugenol, isoeugenol, timol, carvacrol y algunos de sus derivados éster. Los mejores productos para inhibir el patógeno en ensayos in vitro fueron el timol, el butirato de timol y el carvacrol, que inhibieron completamente el crecimiento micelial a 125 mg L y la germinación de conidios a 100 mg L. En frutas de manzana desprendidas, el eugenol, el acetato de eugenilo, el acetato de carvacrilo y el butirato de timol redujeron significativamente los síntomas de BR causados por especies con alguna variación entre experimentos y especies, disminuyendo el riesgo de BR con el tiempo en comparación con el control. En hojas desprendidas, todos los compuestos probados redujeron significativamente el riesgo de desarrollo de síntomas de GLS, con un control de la enfermedad que varió del 30 al 100%. Los compuestos probados son alternativas prometedoras para reemplazar los fungicidas en el control de la podredumbre amarga y las manchas foliares de Glomerella en el cultivo de manzana y deberían ser probados en condiciones de campo.