A pesar de ser el tercer cultivo más consumido, el maíz (L.) es altamente vulnerable al estrés por sequía. El metabolito secundario predominante en las plantas son los ácidos fenólicos, que eliminan especies reactivas de oxígeno para minimizar el estrés oxidativo bajo condiciones de sequía. En este estudio, se ha investigado el efecto de los nanodots de carbono (CND) y las nanopartículas de ferrita de manganeso (MnFeO) sobre la tolerancia al estrés por sequía del maíz. Los resultados experimentales revelaron que las líneas endogámicas tratadas con CND (10 mg L) mostraron la mayor longitud de la hoja (54.0 cm) y ancho (3.9 cm), longitud de raíz (45.2 cm), diámetro del tallo (11.1 mm), peso fresco de raíz (7.0 g), contenido relativo de agua en hojas (84.8%) y contenidos de ácido clorogénico (8.7 ug/mL), ácido cafeico (3.0 ug/mL) y ácido siríngico (1.0 ug/mL). Sin embargo, la mayor longitud de brote (71.5 cm), contenido de humedad en hojas (83.9%), peso fresco de brote (12.5 g), contenido de clorofila (47.3) y actividad de eliminación de radicales libres DPPH (34.1%) se observaron en las líneas tratadas con MnFeO NP (300 mg L) HF12, HW15, 11BS8016-7, HW15, HW12 y KW7, respectivamente. Los resultados indican que CND y MnFeO NP pueden mitigar los efectos del estrés por sequía en diferentes accesiones de la población dada, como lo corroboran las mejoras en el crecimiento y las características fisio-bioquímicas entre varias líneas endogámicas de maíz.