La persistencia de microorganismos en los túbulos dentinarios después de la preparación quimio-mecánica del conducto radicular ha sido bien documentada. La compleja anatomía del conducto radicular y la capacidad de amortiguación de la dentina dificultan la entrega de agentes antimicrobianos. Este trabajo explora el uso de un novedoso sistema de entrega de fármacos basado en nanopartículas de trilámina (TNP) que encapsula digluconato de clorhexidina, con el objetivo de mejorar la desinfección del sistema de conductos radiculares. El digluconato de clorhexidina fue encapsulado dentro de TNPs poliméricos autoensamblados. Estos se autoensamblaron a través de una emulsión de agua en aceite a partir de poli(óxido de etileno)--poli(ácido láctico) (PEG--PLA), un copolímero de bloque di, con un segmento hidrofílico y otro hidrofóbico. Los TNPs resultantes fueron caracterizados fisicoquímicamente y se evaluó su efectividad antimicrobiana utilizando un método de inhibición en caldo. El interior hidrofílico de los TNPs logró atrapar con éxito el digluconato de clorhexidina. Los TNPs resultantes tenían un tamaño de partícula que oscilaba entre 140 y 295 nm, con una eficiencia de encapsulación adecuada, y mantuvieron la inhibición de bacterias durante 21 días. La entrega de irrigantes antibacterianos a través de la matriz dentinaria mediante el uso del sistema TNP descrito en este trabajo puede ser una alternativa efectiva para mejorar la desinfección del conducto radicular.