El carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC) es el sexto cáncer más común en todo el mundo. Está asociado con el consumo de alcohol y tabaco, así como con la infección por virus del papiloma humano (VPH). Las opciones terapéuticas incluyen la radioquimioterapia, la cirugía o la quimioterapia. Las nanopartículas están cobrando cada vez más importancia en la medicina. Pueden ser utilizadas tanto con fines diagnósticos como terapéuticos. Con el fin de proporcionar alternativas terapéuticas en el tratamiento de HNSCC, se probó el efecto de las nanopartículas de óxido de hierro superparamagnético recubiertas de citrato (Citrate-SPIONs) y las nanopartículas de óxido de hierro superparamagnético recubiertas de oro (Au-SPIONs) en combinación con irradiación ionizante (IR) en dos líneas celulares de HNSCC positivas para VPH y dos negativas para VPH, así como en fibroblastos y queratinocitos sanos. Los efectos sobre la apoptosis y necrosis fueron analizados mediante citometría de flujo. Se realizaron estudios de supervivencia celular con un ensayo de formación de colonias. Para comprender mejor dónde interactúan las SPIONs, se realizaron imágenes de microscopía óptica y estudios de inmunofluorescencia. Las líneas celulares de HNSCC y sanas mostraron diferentes respuestas a las SPIONs investigadas. Los efectos citotóxicos de las SPIONs, en combinación con IR, dependen del tipo de SPIONs, la dosis administrada y el tipo de célula tratada. Son independientes del estado de VPH. Las razones de los diferentes efectos citotóxicos probablemente sean las diferentes composiciones de las SPIONs y la diferente interacción de las SPIONs intracelulares y paramembranosas, lo que conduce a diferentes formaciones fuertes de roturas de doble cadena.