La aplicación de la nanotecnología en la agricultura ha aumentado rápidamente. Sin embargo, el destino y los efectos de varias nanopartículas en el suelo, las plantas y los humanos no se comprenden completamente. Los informes indican que las nanopartículas exhiben impactos positivos y negativos en la biota debido a su tamaño, propiedad de superficie, concentración dentro del sistema y tipo de especie o célula bajo prueba. En las plantas, las nanopartículas se translocan ya sea por la vía apoplástica o simpática, o por ambas. Además, no está claro si las nanopartículas que ingresan al sistema de la planta permanecen como nanopartículas o se biotransforman en formas iónicas u otros compuestos orgánicos. Existen resultados controvertidos sobre los efectos tóxicos de los nanomateriales en el sistema de las plantas. En general, la toxicidad de los nanomateriales se ejerce mediante la producción de especies reactivas de oxígeno, lo que lleva a daños o desnaturalización de varias biomoléculas. La intensidad de la cito- y geno-toxicidad depende de las propiedades físicas y químicas de las nanopartículas. Según la revisión de la literatura, se observa que los efectos de las nanopartículas en el crecimiento, la fotosíntesis y el metabolismo primario y secundario de las plantas son tanto positivos como negativos; la respuesta de estos procesos a la nanopartícula estaba asociada con el tipo de nanopartícula, la concentración dentro del tejido, la especie de cultivo y la etapa de crecimiento. Los estudios futuros deberían centrarse en abordar las principales lagunas de conocimiento para comprender las respuestas de las plantas a las nanopartículas en todos los niveles a través de ensayos globales de transcriptoma, proteoma y metaboloma, y evaluar las nanopartículas en condiciones de campo a concentraciones de exposición realistas para determinar el nivel de entrada de nanopartículas en la cadena alimentaria y evaluar el impacto de las nanopartículas en el ecosistema.