Dadas los riesgos asociados con los fungicidas sintéticos, es crucial explorar alternativas seguras y sostenibles. Una solución potencial es el uso de productos naturales bioactivos (BNPs). Sin embargo, los BNPs enfrentan desafíos como la labilidad, la solubilidad y la falta de especificidad. Estos problemas pueden abordarse a través de la nanoencapsulación. Este estudio se centra en la evaluación de nuevos nanocarriers (NCs) de oligómeros de quitosano-hidroxiapatita-carbono nitruro (COS-HAp-g-CN) para encapsular BNPs, específicamente un extracto de corteza. Los NCs fueron caracterizados por microscopía electrónica de transmisión, espectroscopía de rayos X por dispersión de energía y espectroscopía infrarroja. Los NCs eran monodispersos, con un diámetro medio de 250 nm, y mostraron una eficiencia de encapsulación del 82%. La idoneidad de los NCs cargados (COS-HAp-g-CN-BNP, en una proporción de peso de 2:1:0.5:1) para la protección de frutas en postcosecha fue investigada in vitro y ex situ a escala de laboratorio. Se presentan resultados sobre su eficacia contra fresas, mangos, manzanas, duraznos y kiwis. Se encontraron concentraciones inhibitorias mínimas de 250, 375, 375, 250 y 187.5 g·mL in vitro, respectivamente, mientras que se necesitaron dosis más altas (500, 750, 750, 250 y 375 g·mL, respectivamente) para lograr un control efectivo en pruebas de postcosecha en frutas inoculadas artificialmente. Estos hallazgos sugieren que los NCs que contienen extractos de corteza muestran promesa como agentes biorracionales y como alternativas a los fungicidas convencionales para el manejo de fitopatógenos en postcosecha.