Los pigmentos bacterianos (por ejemplo, melanina y carotenoides) se consideran entre los metabolitos secundarios más importantes debido a sus diversas actividades farmacológicas contra el cáncer y la resistencia microbiana. Se aislaron diferentes cepas bacterianas pigmentadas de muestras de suelo de la gobernación de El Mahmoudiyah y se evaluó su actividad antimicrobiana. El productor de pigmento más prometedor fue identificado como MW407006; además, el pigmento producido fue identificado como equinenona (pigmento de beta-caroteno). La producción de pigmento se optimizó a través de un diseño estadístico de composición central para maximizar la producción de biomasa, la concentración de pigmento y la actividad antimicrobiana. Se reveló que los parámetros de fermentación más significativos fueron las concentraciones de glucosa (como fuente de carbono) y asparagina (como fuente de nitrógeno). Se sintetizó nano-equinenona utilizando la técnica de molienda con bolas, se caracterizó y finalmente se evaluó su potencial actividad antimicrobiana, antioxidante y antitumoral. Los datos revelaron que la nano-equinenona sintetizada tenía una mayor actividad antimicrobiana que el pigmento crudo. Se investigó la potencia citotóxica de la equinenona y la nano-equinenona en diferentes líneas celulares (células normales y cancerosas). Se observó la inhibición de la proliferación celular y la inducción de la muerte celular en células Caco-2 y Hep-G2. Los datos demostraron que la nano-equinenona es un candidato adecuado para su uso como un agente antimicrobiano y anti-carcinoma hepatocelular seguro.