El arroz (Oryza sativa) es un alimento básico para más de la mitad de la población mundial, contribuyendo con el 50-80% de la ingesta calórica diaria. La finalización de la secuenciación del genoma del arroz marca un hito significativo en la comprensión de la genómica funcional, sin embargo, la identificación sistemática de las funciones de los genes sigue siendo un obstáculo para la mejora del arroz. Las bibliotecas de mutantes a gran escala en las que se pierden o ganan funciones de los genes (por ejemplo, a través de tratamientos químicos/físicos, T-DNA, transposones, RNAi, CRISPR/Cas9) han demostrado ser herramientas poderosas para vincular sistemáticamente genotipos a fenotipos. Hasta ahora, utilizando diferentes enfoques de mutagénesis, se han establecido un millón de líneas mutantes y se han identificado aproximadamente el 5-10% de las funciones de los genes de arroz predichas debido a las altas demandas de mano de obra y la baja utilización de rendimiento. La mutagénesis a gran escala basada en el código de barras de ADN ofrece una precisión y escalabilidad sin precedentes en la genómica funcional. Esta revisión resume los enfoques de desarrollo de bibliotecas de mutantes de pérdida de función y ganancia de función a gran escala y enfatiza la integración del código de barras de ADN para el análisis agrupado. Códigos de barras de ADN únicos pueden ser etiquetados a transposones/retrotransposones, construcciones de ADN, miARN/siARN, gRNA y cDNA, permitiendo el análisis agrupado y la asignación de funciones a los genes que causan alteraciones fenotípicas. Además, la integración de fenotipificación de alto rendimiento y tecnologías OMICS puede acelerar la identificación de funciones de los genes.