Los murciélagos pueden contribuir a un aumento de aeromycota en ecosistemas subterráneos y podrían ser un vector/reservorio de microorganismos; sin embargo, no hay información sobre el número y la composición de especies de hongos alrededor de los murciélagos en hibernación. Una de las especies más comunes en Europa con contacto humano directo es el murciélago de orejas grandes. El objetivo de nuestra investigación fue el primer informe sobre los hongos en el aire presentes en las cercanías de los murciélagos en hibernación en la reserva de murciélagos de Nietoperek (Polonia Occidental) mediante el uso de técnicas basadas en cultivos e identificaciones genéticas y fenotípicas. Se realizaron investigaciones aerobiológicas de la micobiota bajo los murciélagos en hibernación en dos medios de cultivo (PDA y YPG) y a dos temperaturas de incubación (7 y 24 +/- 0.5 grados C). En total, detectamos 32 especies de hongos de tres filos y 12 géneros. La aplicación del medio YPG y la temperatura de incubación más alta mostraron un mayor número de especies de hongos aisladas y UFC. spp. fueron dominantes en el estudio, con esporas encontradas fuera del sitio de hibernación subterráneo de 51.9% a 86.3% y de 56.7% a 100% dentro de la reserva de murciélagos. fue la especie más frecuentemente aislada, seguida de , , , , , y . La temperatura, la humedad relativa y la abundancia de murciélagos se correlacionaron positivamente con la concentración de propágulos fúngicos en el aire, entre la diversidad de especies de hongos y la concentración de aeromycota, pero el número de especies de hongos no se correlacionó positivamente con el número de murciélagos. El aire en el sitio subterráneo estaba más contaminado por hongos que el aire exterior; sin embargo, la concentración de aeromycota no representa una amenaza para la salud humana. No obstante, los murciélagos en hibernación contribuyen a un aumento de la aeromycota y como un vector/reservorio de hongos microscópicos, incluidos aquellos que pueden causar alergias e infecciones en mamíferos, y deben ser monitoreados.