Multi-year dynamics of single-step genomic prediction in an applied wheat breeding program
Autores: Michel, Sebastian; Löschenberger, Franziska; Sparry, Ellen; Ametz, Christian; Bürstmayr, Hermann
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Multi-year dynamics of single-step genomic prediction in an applied wheat breeding program
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Tecnologías de genotipado
Selección genómica
Programas de cría
Predicción de pedigrí
Ganancia de selección
Predicciones genómicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
La disponibilidad de tecnologías de genotipado rentables ha facilitado la implementación de la selección genómica en numerosos programas de mejoramiento. Sin embargo, algunos estudios han informado de la superioridad del pedigrí sobre la selección genómica en la cría en línea, y dado que, además del mantenimiento sistemático de registros, no se incurre en costos adicionales en la predicción basada en pedigrí, podría surgir la pregunta sobre el beneficio real de tomar las huellas dactilares de varios cientos de líneas cada año. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo arrojar algo de luz sobre esta pregunta comparando modelos de predicción basados en pedigrí, genómicos y de un solo paso utilizando datos fenotípicos y genotípicos recopilados durante un período de diez años en un programa de mejoramiento de trigo aplicado. Los modelos mencionados fueron probados empíricamente en una predicción hacia adelante de varios años, así como en un estudio de simulación de apoyo. Dada la disponibilidad de registros de pedigrí profundos, la predicción basada en pedigrí se desempeñó de manera similar a la predicción genómica para algunos de los rasgos investigados si se disponía de información previa sobre los candidatos a la selección. No obstante, la combinación de ambas fuentes de información aumentó la precisión de la predicción y, por lo tanto, la ganancia en la selección sustancialmente, especialmente para rasgos de baja heredabilidad. Sin embargo, la mayor ventaja de las predicciones genómicas se puede ver en escenarios de mejoramiento donde tal información previa no está sistemáticamente disponible o es difícil y costosa de obtener.
Descripción
La disponibilidad de tecnologías de genotipado rentables ha facilitado la implementación de la selección genómica en numerosos programas de mejoramiento. Sin embargo, algunos estudios han informado de la superioridad del pedigrí sobre la selección genómica en la cría en línea, y dado que, además del mantenimiento sistemático de registros, no se incurre en costos adicionales en la predicción basada en pedigrí, podría surgir la pregunta sobre el beneficio real de tomar las huellas dactilares de varios cientos de líneas cada año. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo arrojar algo de luz sobre esta pregunta comparando modelos de predicción basados en pedigrí, genómicos y de un solo paso utilizando datos fenotípicos y genotípicos recopilados durante un período de diez años en un programa de mejoramiento de trigo aplicado. Los modelos mencionados fueron probados empíricamente en una predicción hacia adelante de varios años, así como en un estudio de simulación de apoyo. Dada la disponibilidad de registros de pedigrí profundos, la predicción basada en pedigrí se desempeñó de manera similar a la predicción genómica para algunos de los rasgos investigados si se disponía de información previa sobre los candidatos a la selección. No obstante, la combinación de ambas fuentes de información aumentó la precisión de la predicción y, por lo tanto, la ganancia en la selección sustancialmente, especialmente para rasgos de baja heredabilidad. Sin embargo, la mayor ventaja de las predicciones genómicas se puede ver en escenarios de mejoramiento donde tal información previa no está sistemáticamente disponible o es difícil y costosa de obtener.