Las aves son altamente sociales y deben estar emparejadas para aumentar su bienestar. La mayoría de las especies de aves son monomórficas; por lo tanto, la determinación molecular del sexo ayuda a proporcionar un bienestar adecuado para las aves. Además, la determinación temprana del sexo puede ser de gran valor para los dueños de aves. El objetivo de este estudio fue demostrar que la identificación del sexo en aves lograda mediante métodos moleculares y muestras recolectadas a través de métodos mínimamente invasivos es rápida, eficiente y precisa. Un total de 100 muestras (29 muestras emparejadas de plumas y hisopos orales y 14 muestras triplicadas de plumas, hisopos orales y sangre) de 43 aves fueron incluidas en este estudio, de la siguiente manera: aves silvestres ( , , aves de tierra-, aves acuáticas-) y aves de compañía ( , -grandes-, medianas- y pequeñas-). La amplificación de los genes y se realizó mediante PCR convencional. Los resultados obtenidos de las plumas se compararon con los obtenidos de los hisopos orales y con los obtenidos de las muestras de sangre, donde fuera aplicable. Los resultados obtenidos muestran que todos los tipos de muestras pueden ser utilizados para la determinación molecular del sexo de todas las especies de aves estudiadas. Hasta donde sabemos, el presente estudio informa, por primera vez, la identificación molecular del sexo en el Siskin Rojo () y el Jilguero (). Para una mayor precisión, nuestra recomendación es utilizar muestras mínimamente invasivas (hisopos orales y plumas) y probar ambos tipos de muestras para cada ave en lugar de muestras de sangre.