Muestra una nueva conexión entre los transposones de ADN eucariotas y procariotas
Autores: Kojima, Kenji K.; Bao, Weidong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Muestra una nueva conexión entre los transposones de ADN eucariotas y procariotas
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Gen del transposasa
Transposones de ADN
Secuencias eucariotas
Duplicaciones del sitio objetivo
Análisis filogenético
Secuencias de proteínas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
El gen de transposasa DDD/E es el gen más abundante en la naturaleza y muchos transposones de ADN en los tres dominios de la vida lo utilizan para su transposición. Un número sustancial de transposones de ADN eucariotas muestra similitud con secuencias de inserción (ISs) procariotas. La presencia de transposones de ADN similares a IS fue indicada en el genoma de . Aquí, examinamos secuencias eucariotas similares a IS utilizando un enfoque bioinformático y reportamos un grupo de transposones de ADN eucariotas similares a IS, designados , de parabasalidos incluyendo . Las longitudes de las duplicaciones del sitio objetivo (TSDs) son de alrededor de 4 pb, alrededor de 15 pb o alrededor de 25 pb, y notablemente, estas longitudes discretas de TSDs pueden observarse incluso en una sola familia. El análisis filogenético indicó las relaciones cercanas de con algunos de los miembros de la familia IS procariota. no se separó bien de / en el análisis filogenético, pero fue distinto de otros transposones de ADN eucariotas incluyendo y . Las características únicas de en las secuencias de proteínas y la distribución de longitudes de TSD apoyan su clasificación como una nueva superfamilia de transposones de ADN eucariotas.
Descripción
El gen de transposasa DDD/E es el gen más abundante en la naturaleza y muchos transposones de ADN en los tres dominios de la vida lo utilizan para su transposición. Un número sustancial de transposones de ADN eucariotas muestra similitud con secuencias de inserción (ISs) procariotas. La presencia de transposones de ADN similares a IS fue indicada en el genoma de . Aquí, examinamos secuencias eucariotas similares a IS utilizando un enfoque bioinformático y reportamos un grupo de transposones de ADN eucariotas similares a IS, designados , de parabasalidos incluyendo . Las longitudes de las duplicaciones del sitio objetivo (TSDs) son de alrededor de 4 pb, alrededor de 15 pb o alrededor de 25 pb, y notablemente, estas longitudes discretas de TSDs pueden observarse incluso en una sola familia. El análisis filogenético indicó las relaciones cercanas de con algunos de los miembros de la familia IS procariota. no se separó bien de / en el análisis filogenético, pero fue distinto de otros transposones de ADN eucariotas incluyendo y . Las características únicas de en las secuencias de proteínas y la distribución de longitudes de TSD apoyan su clasificación como una nueva superfamilia de transposones de ADN eucariotas.