La diversidad de razas de cerdos domésticos y su hibridación aumenta la variedad de fenotipos expresados en los híbridos. El objetivo de este estudio fue cuantificar las diferencias de morfologías craneales entre los cerdos indígenas de Wattle lituanos y sus híbridos con jabalíes. Se realizaron un total de dieciséis mediciones craniométricas en los lados lateral, ventral y dorsal de 71 cráneos de cerdos indígenas de Wattle lituanos y sus híbridos, incluyendo genotipos de 1/4 de jabalí, 1/2 de jabalí y 3/4 de jabalí. El peso del cráneo se vio afectado por el genotipo, el peso vivo y el sexo del animal. El tamaño del cráneo, particularmente relacionado con los parámetros de longitud del cráneo, aumentó consistentemente con el incremento de la proporción de jabalí en los híbridos. Sin embargo, el genotipo no afectó la altura del cráneo. Se pudo realizar una clara discriminación entre los cerdos de la raza local lituana y sus híbridos con diferentes proporciones de jabalí, así como entre los grupos individuales de híbridos. La clasificación más correcta se determinó en base a los parámetros generales y de longitud de los cráneos. Esto podría contribuir a una mejor gestión y utilización de los híbridos.