El objetivo principal de este trabajo fue estudiar el riesgo de erosión genética de plantas con aplicaciones aromáticas, medicinales y gastronómicas en Portugal, particularmente en la región del Alentejo. Las especies objetivo fueron el cilantro (L.), la menta de agua (L.) y la menta (L.). La metodología involucró observaciones directas y encuestas (2002/2003 y 2011). Se utilizó la fórmula GE aplicada en los estudios de Hammer para estimar la erosión genética. Los principales factores que causan la erosión genética fueron los impulsores primarios de la pérdida de biodiversidad: la pérdida de hábitat, las especies invasoras y la sobreexplotación influenciada por la intervención humana, como el desbroce de cursos de agua, el control de la vegetación, el pastoreo y la desertificación. Los resultados indican una reducción en el número de individuos por especie en el Alentejo, con una pérdida neta de erosión del 11% para el cilantro, 32% para la menta de agua y 33% para la menta. La pérdida total de accesiones (riesgo de erosión genética) fue mayor en accesiones cultivadas (33%) que en accesiones silvestres (11%), con una tasa anual de erosión genética del 3.7% y 1.2%, respectivamente. El riesgo anual de erosión genética para accesiones recolectadas en un hábitat natural fue del 0.6%, que es mucho menor que el 3.7% para el cilantro. Estos resultados consolidan la importancia de recolectar y conservar recursos genéticos.