Los efectos directos e indirectos después de que las operaciones mineras cesen deben ser idealmente sometidos a rutinas de monitoreo perpetuo para detectar posibles riesgos o evitar efectos adversos en los ecosistemas circundantes en una etapa temprana. En esta contribución, se analizan los lagos de subsidencia minera creados dentro de la reserva natural Kirchheller Heide y el Bosque de Hilsfeld para un esquema de monitoreo a largo plazo. Para este propósito, empleamos herramientas de mapeo multispectral y térmico basadas en sistemas aéreos no tripulados (UAS) para proporcionar un método de monitoreo ambiental rápido, no invasivo y multitemporal. Específicamente, proponemos monitorear la evolución de la vegetación a través de análisis multispectral, identificación de biotipos utilizando algoritmos de aprendizaje automático y detección de la extensión de la superficie del agua, junto con su comportamiento térmico. El objetivo de esta contribución es presentar el flujo de trabajo propuesto y los primeros resultados para establecer una línea base para futuros análisis y encuestas subsiguientes para un monitoreo multitemporal a largo plazo.