Identificar qué tipos de células están involucrados en enfermedades es crucial para desarrollar mejores tratamientos. Las nuevas tecnologías de secuenciación de ARN de una sola célula permiten a los investigadores estudiar células individuales en gran detalle, pero etiquetar estas células con precisión sigue siendo difícil. Muchas herramientas actuales dependen del conocimiento previo, lo que puede llevar a errores. Desarrollamos FPCAM, una herramienta totalmente automatizada que identifica con precisión los tipos de células relacionadas con los pulmones, especialmente en enfermedades como la fibrosis pulmonar. FPCAM utiliza patrones de genes marcadores y una referencia curada para hacer predicciones confiables. Superó a varias herramientas populares y identificó con precisión subtipos celulares específicos en un conjunto de datos separado. FPCAM está disponible de forma gratuita y es fácil de acceder en línea.