En este documento, se formula y analiza un modelo eco-epidemiológico de orden fraccional con dos cepas de enfermedades en la población depredadora que incorpora la cosecha. El modelo asume que la población está dividida en una población de presas, una población de depredadores susceptibles, una población de depredadores infectados por la primera enfermedad y una población de depredadores infectados por la segunda enfermedad. Se realiza un análisis matemático y simulaciones numéricas para explicar la dinámica y propiedades del modelo eco-epidemiológico de orden fraccional propuesto. Se examinan la positividad, la acotación, la existencia y la unicidad de las soluciones. Se obtiene el número básico de reproducción y algunas condiciones suficientes para la existencia de cuatro puntos de equilibrio. Además, se proponen algunas condiciones suficientes para garantizar la estabilidad asintótica local y global de los puntos de equilibrio. Los resultados teóricos se ilustran a través de simulaciones numéricas, que también destacan el efecto del orden fraccional.