Construcción y evaluación de un modelo de riesgo relacionado con el dominio para la predicción del pronóstico en el cáncer colorrectal
Autores: Cui, Xiangjun; Xing, Yongqiang; Liu, Guoqing; Zhao, Hongyu; Yang, Zhenhua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Construcción y evaluación de un modelo de riesgo relacionado con el dominio para la predicción del pronóstico en el cáncer colorrectal
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Ingeniería de Sistemas
Palabras clave
Inestabilidad epigenómica
Genes supresores de tumores
Oncogenes
Modificaciones de histonas
Proteínas que contienen dominios
Cáncer colorrectal
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
La inestabilidad epigenómica acelera las mutaciones en genes supresores de tumores y oncogenes, contribuyendo a la transformación maligna. Las modificaciones de histonas, especialmente la metilación y acetilación, influyen significativamente en la biología tumoral, con proteínas que contienen dominios cromo-, bromo- y Tudor mediando estos cambios. Este estudio investiga cómo los genes que codifican estas proteínas que contienen dominios afectan el pronóstico del cáncer colorrectal (CCR). Usando datos de CCR de los conjuntos de datos GSE39582 y TCGA, identificamos genes relacionados con dominios a través de GeneCards y desarrollamos una firma pronóstica utilizando regresión LASSO-COX. Los pacientes se clasificaron en grupos de alto y bajo riesgo, y se realizaron comparaciones en cuanto a supervivencia, características clínicas, infiltración de células inmunitarias, respuestas a la inmunoterapia y predicciones de sensibilidad a medicamentos. El análisis de células individuales evaluó la expresión génica en diferentes subconjuntos celulares. Cuatro genes relacionados con dominios (, , , y ) fueron identificados como una firma pronóstica. La validación confirmó su valor pronóstico, con diferencias significativas en la supervivencia, características clínicas, patrones inmunitarios y respuestas a la inmunoterapia entre los grupos de alto y bajo riesgo. El análisis de sensibilidad a medicamentos reveló los principales candidatos para el tratamiento del CCR. El análisis de células individuales mostró una expresión variada de estos genes en diferentes subconjuntos celulares. Este estudio presenta una nueva firma pronóstica basada en genes relacionados con dominios que pueden predecir la gravedad del CCR y ofrecer información sobre la dinámica inmunitaria, proporcionando una herramienta prometedora para la evaluación personalizada del riesgo en el CCR.
Descripción
La inestabilidad epigenómica acelera las mutaciones en genes supresores de tumores y oncogenes, contribuyendo a la transformación maligna. Las modificaciones de histonas, especialmente la metilación y acetilación, influyen significativamente en la biología tumoral, con proteínas que contienen dominios cromo-, bromo- y Tudor mediando estos cambios. Este estudio investiga cómo los genes que codifican estas proteínas que contienen dominios afectan el pronóstico del cáncer colorrectal (CCR). Usando datos de CCR de los conjuntos de datos GSE39582 y TCGA, identificamos genes relacionados con dominios a través de GeneCards y desarrollamos una firma pronóstica utilizando regresión LASSO-COX. Los pacientes se clasificaron en grupos de alto y bajo riesgo, y se realizaron comparaciones en cuanto a supervivencia, características clínicas, infiltración de células inmunitarias, respuestas a la inmunoterapia y predicciones de sensibilidad a medicamentos. El análisis de células individuales evaluó la expresión génica en diferentes subconjuntos celulares. Cuatro genes relacionados con dominios (, , , y ) fueron identificados como una firma pronóstica. La validación confirmó su valor pronóstico, con diferencias significativas en la supervivencia, características clínicas, patrones inmunitarios y respuestas a la inmunoterapia entre los grupos de alto y bajo riesgo. El análisis de sensibilidad a medicamentos reveló los principales candidatos para el tratamiento del CCR. El análisis de células individuales mostró una expresión variada de estos genes en diferentes subconjuntos celulares. Este estudio presenta una nueva firma pronóstica basada en genes relacionados con dominios que pueden predecir la gravedad del CCR y ofrecer información sobre la dinámica inmunitaria, proporcionando una herramienta prometedora para la evaluación personalizada del riesgo en el CCR.