Un modelo para la red de regulación genética a lo largo del eje medio-lateral del fruto de Arabidopsis: reconfigurando el proceso de ruptura de la vaina
Autores: Moya-Cuevas, José; Ortiz-Gutiérrez, Elizabeth; López-Sánchez, Patricio; Simón-Moya, Miguel; Ballester, Patricia; Álvarez-Buylla, Elena R.; Ferrándiz, Cristina
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Un modelo para la red de regulación genética a lo largo del eje medio-lateral del fruto de Arabidopsis: reconfigurando el proceso de ruptura de la vaina
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Estrategias evolutivas
Frutos de angiospermas
Unidades de dispersión de semillas
Frutos dehiscente
Red reguladora de genes
Arabidopsis
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Diferentes estrategias evolutivas convergentes adoptadas por los frutos de angiospermas conducen a diversas unidades funcionales de dispersión de semillas. Los frutos secos dehiscentes son un tipo común de fruto, caracterizados por su falta de pericarpio carnoso y la liberación de semillas en la madurez a través de aberturas (zonas de dehiscencia, DZs) en su estructura. En décadas anteriores, un conjunto de actores clave en la formación de DZ ha sido intensamente caracterizado en Arabidopsis e integrado en una red de regulación genética (GRN) que explica la morfogénesis de estos tejidos. En este trabajo, recopilamos todos los datos experimentales disponibles hasta la fecha para construir un modelo booleano discreto como un enfoque mecanicista para validar la red y, si es necesario, identificar componentes faltantes de la GRN y/o proponer nuevas interacciones regulatorias hipotéticas, pero también para proporcionar un nuevo marco formal que alimente trabajos futuros en el desarrollo de frutos de Brassicaceae y la evolución de los mecanismos de dispersión de semillas. Así, mediante validaciones in-silico exhaustivas y evidencia experimental, somos capaces de incorporar tanto el factor de transcripción NO TRANSMITTING TRACT (NTT) como un nuevo nodo adicional, y un nuevo conjunto de reglas regulatorias hipotéticas para descubrir la dinámica de la especificación de DZ en Arabidopsis.
Descripción
Diferentes estrategias evolutivas convergentes adoptadas por los frutos de angiospermas conducen a diversas unidades funcionales de dispersión de semillas. Los frutos secos dehiscentes son un tipo común de fruto, caracterizados por su falta de pericarpio carnoso y la liberación de semillas en la madurez a través de aberturas (zonas de dehiscencia, DZs) en su estructura. En décadas anteriores, un conjunto de actores clave en la formación de DZ ha sido intensamente caracterizado en Arabidopsis e integrado en una red de regulación genética (GRN) que explica la morfogénesis de estos tejidos. En este trabajo, recopilamos todos los datos experimentales disponibles hasta la fecha para construir un modelo booleano discreto como un enfoque mecanicista para validar la red y, si es necesario, identificar componentes faltantes de la GRN y/o proponer nuevas interacciones regulatorias hipotéticas, pero también para proporcionar un nuevo marco formal que alimente trabajos futuros en el desarrollo de frutos de Brassicaceae y la evolución de los mecanismos de dispersión de semillas. Así, mediante validaciones in-silico exhaustivas y evidencia experimental, somos capaces de incorporar tanto el factor de transcripción NO TRANSMITTING TRACT (NTT) como un nuevo nodo adicional, y un nuevo conjunto de reglas regulatorias hipotéticas para descubrir la dinámica de la especificación de DZ en Arabidopsis.