Modelo basado en la caracterización del metabolismo de la producción de virus adenoasociados recombinantes (rAAV) a través de células renales embrionarias humanas (HEK293)
Autores: Khodadadi Karimvand, Somaiyeh; Cuperlovic-Culf, Miroslava; Kamen, Amine A.; Bolic, Miodrag
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Modelo basado en la caracterización del metabolismo de la producción de virus adenoasociados recombinantes (rAAV) a través de células renales embrionarias humanas (HEK293)
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Modelo metabólico
Virus adenoasociado
Células HEK293
Modelo cinético-metabólico
Cinética de Michaelis-Menten
Análisis de sensibilidad global
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 32
Citaciones: Sin citaciones
En este documento, presentamos un modelo cinético-metabólico que describe la producción del virus adenoasociado (AAV) a través de células HEK293 e incluye las principales vías metabólicas, como la glucólisis, el ciclo del ácido tricarboxílico (TCA), los destinos del piruvato, la vía de las pentosas fosfato, la reacción anaplérotica, el metabolismo de aminoácidos, la síntesis de nucleótidos, la síntesis de biomasa y las vías metabólicas de la síntesis de proteínas del AAV (proteínas de cápside y Rep). Para el modelado, se asumió la cinética de Michaelis-Menten para definir el modelo metabólico. Se utilizó un conjunto de datos de cultivos en biorreactores que contenían perfiles de metabolitos de la producción del virus adenoasociado 6 (AAV6) a través de una triple transfección transitoria en un cultivo de baja densidad celular, incluidos los perfiles de concentración de glutamina, ácido glutámico, glucosa, lactato y amonio, para ajustar y calcular los parámetros del modelo. El modelo resultante de los parámetros ajustados se ajustó bien a los datos experimentales. Posteriormente, se aplicó un procedimiento de análisis de sensibilidad global basado en Sobol para determinar los parámetros más sensibles en el modelo final.
Descripción
En este documento, presentamos un modelo cinético-metabólico que describe la producción del virus adenoasociado (AAV) a través de células HEK293 e incluye las principales vías metabólicas, como la glucólisis, el ciclo del ácido tricarboxílico (TCA), los destinos del piruvato, la vía de las pentosas fosfato, la reacción anaplérotica, el metabolismo de aminoácidos, la síntesis de nucleótidos, la síntesis de biomasa y las vías metabólicas de la síntesis de proteínas del AAV (proteínas de cápside y Rep). Para el modelado, se asumió la cinética de Michaelis-Menten para definir el modelo metabólico. Se utilizó un conjunto de datos de cultivos en biorreactores que contenían perfiles de metabolitos de la producción del virus adenoasociado 6 (AAV6) a través de una triple transfección transitoria en un cultivo de baja densidad celular, incluidos los perfiles de concentración de glutamina, ácido glutámico, glucosa, lactato y amonio, para ajustar y calcular los parámetros del modelo. El modelo resultante de los parámetros ajustados se ajustó bien a los datos experimentales. Posteriormente, se aplicó un procedimiento de análisis de sensibilidad global basado en Sobol para determinar los parámetros más sensibles en el modelo final.