En los sensores recargables inalámbricos (WRSNs), el sistema es vulnerable a ser atacado por malware. Debido a la estructura de red distribuida de WRSNs, el ataque de malware tiene gran influencia en el sistema de seguridad de WRSNs. Con la variabilidad en el malware, el problema de descifrado y errores de codificación llevará a la mutación del malware. En este documento, hay dos problemas que deben ser resueltos, incluyendo la mutación del malware y el retraso de carga en WRSNs. Se introducen el estado de mutación del malware y el estado de baja energía. En primer lugar, se presentan tres soluciones de equilibrio diferentes del modelo de mutación. Luego, se demuestra la estabilidad local mediante la ecuación característica, y el sistema se estabilizará en diferentes soluciones de equilibrio cuando el número reproductivo base es diferente. Con la condición de retraso de carga, se investiga el fenómeno de bifurcación utilizando la teoría de bifurcación de Hopf. Además, para mejorar la seguridad de WRSNs y disminuir el costo de control, se aplica el Principio del Máximo de Pontryagin para obtener un esquema de control óptimo bajo mutación y retraso de carga. Finalmente, se aplica la simulación numérica mediante Matlab para confirmar este modelo. Los resultados de la simulación muestran que el malware de mutación puede ser controlado cuando el retraso es menor que el umbral máximo.