El carbono orgánico del suelo (COS) es un componente obligatorio en los informes de inventario nacional sobre emisiones y remociones de gases de efecto invernadero (GEI) ante la CMNUCC. Por lo tanto, su evaluación precisa es importante. Se fomenta la modelización de los cambios en el COS para los informes nacionales de GEI, pero la incertidumbre relacionada con este componente sigue presentando un desafío significativo; por lo tanto, es esencial verificar los resultados de la modelización con observaciones de campo. Utilizamos el modelo basado en procesos Biome-BGCMuSo y evaluamos su idoneidad para su uso en la elaboración de informes de GEI de Croacia. Modelamos los stocks de COS en los 30 cm superiores de la capa de suelo mineral (COS30) para cuatro categorías de uso de la tierra (Bosque Deciduo/Conífero, Pastizal y Cultivo Anual) distribuidas en tres regiones biogeográficas (Alpina, Continental y Mediterránea) y los comparamos con los resultados de un estudio nacional del suelo. Se realizaron un total de 573 simulaciones a nivel de parcela y los resultados se evaluaron en tres niveles de estratificación (Uso de la Tierra, Uso de la Tierra x región biogeográfica y parcela). El modelo reprodujo la media nacional general de COS30 sin sesgo general y mostró un buen rendimiento a nivel de Uso de la Tierra sin diferencias significativas (p < 0.05) para todos los Usos de la Tierra excepto el Bosque Deciduo (11% de sobreestimación). En estratificaciones más finas, el rendimiento del modelo empeoró considerablemente. Se necesita una mayor calibración, mejora y prueba del modelo, así como un estudio del suelo repetido para evaluar los cambios en COS30 y evaluar el potencial del modelo Biome-BGCMuSo para su uso en la elaboración de informes de GEI.