Un Modelo Gamético Multivariante Bayesiano en un Cruce Recíproco con Información Genómica: Un Ejemplo con Dos Variedades Ibéricas
Autores: Srihi, Houssemeddine; López-Carbonell, David; Ibáñez-Escriche, Noelia; Casellas, Joaquim; Hernández, Pilar; Negro, Sara; Varona, Luis
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Un Modelo Gamético Multivariante Bayesiano en un Cruce Recíproco con Información Genómica: Un Ejemplo con Dos Variedades Ibéricas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Programa de cruce
Variedades de cerdo ibérico
Cerda híbrida
Efectos de impronta genética
Modelo gamético multivariante
Correlaciones gaméticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
INGA FOOD, S.A. inició un programa de cruce entre dos variedades de cerdo ibérico, Retinto (R) y Entrepelado (E), con el objetivo de producir una cerda híbrida (F1). Se han realizado varios estudios para evaluar su rendimiento productivo, y estos estudios han revelado diferencias en el tamaño de la camada entre los dos cruces recíprocos, sugiriendo la presencia de efectos de impronta genética. Para investigar más a fondo estos efectos, este estudio introduce un modelo gamético multivariante diseñado para estimar correlaciones gaméticas entre los efectos paternos y maternos que se originan de ambos antecedentes genéticos involucrados en los cruces recíprocos. El conjunto de datos consistió en 1258 registros (el total de nacidos-TNB y el número de nacidos vivos-NBA) de 203 madres cruzadas para el cruce Entrepelado (padre) x Retinto (madre) y 700 registros de 125 madres cruzadas para el cruce Retinto (padre) x Entrepelado (madre). Todos los animales fueron genotipados utilizando el GeneSeek GPP Porcine 70 K HDchip (Illumina Inc., San Diego, CA, EE. UU.). Los resultados indicaron que la distribución posterior de la correlación gamética entre los efectos paternos y maternos era claramente diferente entre las dos poblaciones. Específicamente, en la población Retinto, la correlación gamética mostró una asimetría positiva con probabilidades posteriores de 0.78 para el TNB y 0.80 para el NBA. Por otro lado, la población Entrepelado mostró una probabilidad posterior de una correlación gamética positiva entre los efectos paternos y maternos de aproximadamente 0.50. Las diferencias en la forma de la distribución posterior de las correlaciones gaméticas entre los efectos paternos y maternos observadas en las dos variedades pueden explicar los distintos resultados de rendimiento observados en los cruces recíprocos.
Descripción
INGA FOOD, S.A. inició un programa de cruce entre dos variedades de cerdo ibérico, Retinto (R) y Entrepelado (E), con el objetivo de producir una cerda híbrida (F1). Se han realizado varios estudios para evaluar su rendimiento productivo, y estos estudios han revelado diferencias en el tamaño de la camada entre los dos cruces recíprocos, sugiriendo la presencia de efectos de impronta genética. Para investigar más a fondo estos efectos, este estudio introduce un modelo gamético multivariante diseñado para estimar correlaciones gaméticas entre los efectos paternos y maternos que se originan de ambos antecedentes genéticos involucrados en los cruces recíprocos. El conjunto de datos consistió en 1258 registros (el total de nacidos-TNB y el número de nacidos vivos-NBA) de 203 madres cruzadas para el cruce Entrepelado (padre) x Retinto (madre) y 700 registros de 125 madres cruzadas para el cruce Retinto (padre) x Entrepelado (madre). Todos los animales fueron genotipados utilizando el GeneSeek GPP Porcine 70 K HDchip (Illumina Inc., San Diego, CA, EE. UU.). Los resultados indicaron que la distribución posterior de la correlación gamética entre los efectos paternos y maternos era claramente diferente entre las dos poblaciones. Específicamente, en la población Retinto, la correlación gamética mostró una asimetría positiva con probabilidades posteriores de 0.78 para el TNB y 0.80 para el NBA. Por otro lado, la población Entrepelado mostró una probabilidad posterior de una correlación gamética positiva entre los efectos paternos y maternos de aproximadamente 0.50. Las diferencias en la forma de la distribución posterior de las correlaciones gaméticas entre los efectos paternos y maternos observadas en las dos variedades pueden explicar los distintos resultados de rendimiento observados en los cruces recíprocos.