La pandemia de COVID-19 sigue siendo un problema en Sudáfrica. Las personas afectadas e infectadas por la enfermedad sufren de estigma, lo que resulta en un aumento de las infecciones por COVID-19. En este documento, desarrollamos un modelo matemático para evaluar los efectos del estigma en el COVID-19 en Sudáfrica, utilizando regímenes de estigma bajos, moderados y altos en la población. El modelo matemático fue analizado y se determinó el número básico de reproducción, , del modelo de COVID-19 con estigma. Luego, el modelo se ajustó a los datos de las cuatro olas de COVID-19 para los nuevos casos diarios infectados, y se presentaron los valores de los parámetros estimados de diferentes olas. Se examinaron los efectos del estigma en las olas de COVID-19 utilizando los cuatro regímenes de estigma (alto, moderado, bajo y libre de estigma). Nuestros resultados revelaron que el estigma es fundamental en el aumento del número de infecciones por COVID-19. También es un contribuyente significativo para mantener el COVID-19 en la población y probablemente en otras enfermedades infecciosas como el VIH/SIDA y las enfermedades de transmisión sexual. Los resultados obtenidos pueden influir en las direcciones de las políticas con respecto al estigma y su impacto en la dinámica de transmisión de enfermedades.