La transmisión sináptica es el principal proceso que proporciona actividad de interconexión entre neuronas en el sistema nervioso central (SNC). En el presente estudio, se desarrolló un modelo matemático en 3D de un botón neuronal con una localización en grupo de receptores de glicina (GlyRs) en la membrana postsináptica. El número y la posición eventual de los receptores están definidos por los datos estructurales del complejo GlyR-gefirina. Además, la formación del potencial postsináptico inhibitorio (IPSP) y una electro-difusión de iones de cloruro fueron evaluadas aplicando problemas de límite para una ecuación de Poisson y una ecuación de difusión en estado no estacionario, respectivamente. Se mostró que los cambios locales en la concentración de iones de cloruro cerca de la membrana postsináptica, mediados por la activación de GlyRs, pueden aumentar hasta un 80-110% desde el nivel inicial. El valor promedio del aumento de la concentración fue de hasta un 10% en un pico de actividad bajo la activación completa de GlyRs. La localización espacial central de los GlyRs en el grupo tuvo una diferencia considerable tanto en los cambios de concentración de iones de cloruro (6%) como en el IPSP (17%) en comparación con la localización dividida o trasera. Por lo tanto, un polimorfismo espacial de la densidad postsináptica de GlyRs es importante para formar una respuesta fisiológica a la liberación de neuromediadores.