Se investigaron un total de 32 proteínas sintéticas diseñadas por Michael Hecht y sus colaboradores utilizando herramientas estándar de bioinformática para el modelado de estructura y función. El conjunto de datos consistió en 15 alfa-proteínas artificiales (Hecht_alpha) diseñadas para plegarse en haces de cuatro hélices de 102 residuos y 17 proteínas de lámina beta de seis hebras (Hecht_beta). Comparamos las propiedades determinadas experimentalmente de las secuencias investigadas con los resultados de métodos computacionales para la predicción de la estructura de proteínas y bioactividad. La conclusión alcanzada es que el conjunto de datos de Michael Hecht y sus colaboradores podría ser utilizado con éxito tanto para probar métodos actuales como para desarrollar nuevos para la caracterización de moléculas diseñadas artificialmente basadas en los patrones binarios específicos de la polaridad de los aminoácidos. Las investigaciones comparativas de los métodos de bioinformática sobre los conjuntos de datos de proteínas de novo y naturales pueden llevar a: (1) mejora de las herramientas existentes para el análisis de la estructura y función de proteínas; (2) nuevos algoritmos para la construcción de subconjuntos de proteínas de novo; y (3) información adicional sobre el complejo espacio de secuencias naturales y su relación con los subespacios individuales de las secuencias de novo. Se necesitan investigaciones adicionales sobre conjuntos de datos diferentes y variados para confirmar la aplicabilidad general de este concepto.