Modelado del tiempo de floración en con Aproximación de Cómputo Bayesiano
Autores: Ageev, Andrey; Lee, Cheng-Ruei; Ting, Chau-Ti; Schafleitner, Roland; Bishop-von Wettberg, Eric; Nuzhdin, Sergey V.; Samsonova, Maria; Kozlov, Konstantin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Modelado del tiempo de floración en con Aproximación de Cómputo Bayesiano
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Tiempo de floración
Modelos
Factores climáticos
Información genética
Temperatura
Accesiones
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
El tiempo de floración es un objetivo importante para los criadores en el desarrollo de nuevas variedades adaptadas a condiciones cambiantes. Se propone un nuevo enfoque que utiliza Aproximación Bayesiana Aproximada con Evolución Diferencial para construir un conjunto de modelos para el tiempo de floración. Las funciones para la progresión diaria de la planta desde la siembra hasta la floración se obtienen en forma analítica y dependen de los valores diarios de factores climáticos e información genética. El conjunto resultante de modelos demostró una alta precisión en el conjunto de datos. La duración del día, la radiación solar y la temperatura tuvieron un gran impacto en la precisión del modelo, mientras que el impacto de la precipitación fue comparativamente pequeño y el impacto de la temperatura máxima tuvo la máxima variación. El conjunto de modelos se utilizó para investigar el comportamiento de las accesiones del conjunto de datos en caso de un aumento de temperatura por -. El tiempo de floración cambió de manera diferente para diferentes accesiones. El coeficiente de correlación de Pearson entre el valor del SNP y el cambio en el tiempo de floración reveló una asociación débil pero significativa del SNP7 con el comportamiento de las accesiones en condiciones de calentamiento climático. El mismo SNP se encontró que tiene una influencia considerable en la predicción del modelo con una prueba de permutación. Nuestro enfoque puede ayudar a los programas de cría a aprovechar la diversidad genotípica y fenotípica para producir de manera más efectiva variedades con un tiempo de floración deseado.
Descripción
El tiempo de floración es un objetivo importante para los criadores en el desarrollo de nuevas variedades adaptadas a condiciones cambiantes. Se propone un nuevo enfoque que utiliza Aproximación Bayesiana Aproximada con Evolución Diferencial para construir un conjunto de modelos para el tiempo de floración. Las funciones para la progresión diaria de la planta desde la siembra hasta la floración se obtienen en forma analítica y dependen de los valores diarios de factores climáticos e información genética. El conjunto resultante de modelos demostró una alta precisión en el conjunto de datos. La duración del día, la radiación solar y la temperatura tuvieron un gran impacto en la precisión del modelo, mientras que el impacto de la precipitación fue comparativamente pequeño y el impacto de la temperatura máxima tuvo la máxima variación. El conjunto de modelos se utilizó para investigar el comportamiento de las accesiones del conjunto de datos en caso de un aumento de temperatura por -. El tiempo de floración cambió de manera diferente para diferentes accesiones. El coeficiente de correlación de Pearson entre el valor del SNP y el cambio en el tiempo de floración reveló una asociación débil pero significativa del SNP7 con el comportamiento de las accesiones en condiciones de calentamiento climático. El mismo SNP se encontró que tiene una influencia considerable en la predicción del modelo con una prueba de permutación. Nuestro enfoque puede ayudar a los programas de cría a aprovechar la diversidad genotípica y fenotípica para producir de manera más efectiva variedades con un tiempo de floración deseado.