Minería de homólogos de genes de resistencia a enfermedades clonados (CDRHs) en especies y
Autores: Cantila, Aldrin Y.; Neik, Ting X.; Tirnaz, Soodeh; Thomas, William J. W.; Bayer, Philipp E.; Edwards, David; Batley, Jacqueline
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Minería de homólogos de genes de resistencia a enfermedades clonados (CDRHs) en especies y
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Enfermedades
Cultivos
Genes de resistencia
Fúngicos
Bacterianos
Brassicaceae
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 33
Citaciones: Sin citaciones
Varias enfermedades afectan gravemente los cultivos, lo que lleva a pérdidas significativas en los rendimientos globales y a una reducción en la calidad de los cultivos. En este estudio, utilizamos las secuencias de proteínas completas de 49 genes de resistencia clonados que confieren resistencia a enfermedades fúngicas y bacterianas conocidas por impactar especies de la familia Brassicaceae. Se llevaron a cabo búsquedas de homología en los genomas. En total, se identificaron 660 homólogos de genes de enfermedad clonados (CDRHs) en las siete especies, incluyendo 431 análogos de genes de resistencia (RGAs) (248 repeticiones ricas en leucina de sitios de unión a nucleótidos (NLRs), 150 quinasas de proteínas tipo receptor (RLKs) y 33 proteínas tipo receptor (RLPs)) y 229 no-RGAs. Basado en la posición y distribución de homólogos específicos en cada una de las especies, observamos un total de 87 clústeres de CDRH compuestos por 36 clústeres homogéneos de NLR, 16 de RLK y 3 de RLP, y 32 clústeres heterogéneos. Los CDRHs detectados de manera consistente en las siete especies son candidatos que pueden ser investigados para resistencia de amplio espectro, proporcionando potencialmente resistencia a múltiples patógenos. Los genes identificados en este estudio proporcionan un recurso novedoso para el futuro análisis funcional y clonación de genes de Brassicaceae hacia la mejora de cultivos.
Descripción
Varias enfermedades afectan gravemente los cultivos, lo que lleva a pérdidas significativas en los rendimientos globales y a una reducción en la calidad de los cultivos. En este estudio, utilizamos las secuencias de proteínas completas de 49 genes de resistencia clonados que confieren resistencia a enfermedades fúngicas y bacterianas conocidas por impactar especies de la familia Brassicaceae. Se llevaron a cabo búsquedas de homología en los genomas. En total, se identificaron 660 homólogos de genes de enfermedad clonados (CDRHs) en las siete especies, incluyendo 431 análogos de genes de resistencia (RGAs) (248 repeticiones ricas en leucina de sitios de unión a nucleótidos (NLRs), 150 quinasas de proteínas tipo receptor (RLKs) y 33 proteínas tipo receptor (RLPs)) y 229 no-RGAs. Basado en la posición y distribución de homólogos específicos en cada una de las especies, observamos un total de 87 clústeres de CDRH compuestos por 36 clústeres homogéneos de NLR, 16 de RLK y 3 de RLP, y 32 clústeres heterogéneos. Los CDRHs detectados de manera consistente en las siete especies son candidatos que pueden ser investigados para resistencia de amplio espectro, proporcionando potencialmente resistencia a múltiples patógenos. Los genes identificados en este estudio proporcionan un recurso novedoso para el futuro análisis funcional y clonación de genes de Brassicaceae hacia la mejora de cultivos.