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Minería a nivel genómico de los genes de ligasa de ubiquitina E3 CULLIN de

Autores: Shao, Yingying; Mu, Detian; Zhou, Yu; Liu, Xinghui; Huang, Xueshuang; Wilson, Iain W.; Qi, Yuxin; Lu, Ying; Zhu, Lina; Zhang, Yao; Qiu, Deyou; Tang, Qi

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Minería a nivel genómico de los genes de ligasa de ubiquitina E3 CULLIN de


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Cul
Proteína
Familia de genes
Respuesta al estrés
Síntesis de metabolitos secundarios
ácido abscísico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 13

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La proteína CULLIN (CUL) es un subtipo de ligasa de ubiquitina E3 que está involucrada en una variedad de procesos biológicos y respuestas al estrés en las plantas. En , la familia de genes no ha sido identificada y su papel en el desarrollo de las plantas, la respuesta al estrés y la síntesis de metabolitos secundarios no ha sido estudiado. En este estudio, 12 miembros del gen contenían todos el dominio típico N-terminal y el dominio C-terminal identificados del genoma y fueron clasificados en cuatro subfamilias basadas en la relación filogenética con en . Estaban distribuidos de manera desigual en ocho cromosomas, pero tenían una composición estructural similar en la misma subfamilia, lo que indica que eran relativamente conservados y potencialmente tenían funciones génicas similares. Un análisis de colinealidad inter e intraespecífica mostró que la duplicación de fragmentos jugó un papel importante en la evolución de la familia de genes. El análisis de los elementos -actuantes sugiere que el puede jugar un papel importante en varios procesos biológicos, incluyendo la respuesta al ácido abscísico (ABA). Para investigar esta hipótesis, tratamos las raíces de plántulas cultivadas en tejido con ABA. El análisis del patrón de expresión mostró que todos los genes estaban ampliamente expresados en raíces con varios patrones de expresión. El análisis de asociación de coexpresión de los y genes de enzimas clave en la vía de síntesis de alcaloides indólicos terpenoides (TIA) reveló los complejos patrones de expresión de 12 genes y algunos genes de enzimas clave de TIA, especialmente , , y que podrían estar involucrados en la biosíntesis de TIAs. Los resultados mostraron que los estaban involucrados en la respuesta a las hormonas ABA, proporcionando información importante para elucidar la función de UrCULs en . La minería de en el genoma completo de proporcionó nueva información para entender el gen y su función en los metabolitos secundarios de las plantas, el crecimiento y el desarrollo.

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